เนื่องจากซุยโฮเด็นซึ่งถือเป็นสิ่งของจัดแสดงกลางแจ้งนั้น ตั้งอยู่ท่ามกลางสภาพอากาศตามธรรมชาติ จึงมีการจัดการโดยการระมัดระวังในเรื่องของอุณหภูมิความชื้น รังสี และการเสื่อมเสียทางชีวภาพเป็นพิเศษ อีกทั้ง แม้แต่ภายในพิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ที่มีการปรับแต่งสภาพแวดล้อมเองก็มีการใส่ใจในการจัดแสดงโดยปรับให้เข้ากับคุณสมบัติวัตถุดิบและสภาพของเอกสาร รวมถึงมีการจัดเก็บเอกสารที่มีวัตถุประสงค์เฉพาะในการเก็บรักษาไว้ที่ตู้เก็บเอกสารอีกด้วย
ที่พิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ซุยโฮเด็นมีการดำเนินการเพื่อรักษาซุยโฮเด็นซึ่งเป็นอาคารที่จัดแสดงกลางแจ้ง โดยเริ่มจากการสำรวจสภาพอากาศรายปี การสำรวจการเสื่อมสภาพของอาคารและส่วนที่มีการตกแต่ง การป้องกันกำจัดเชื้อราและแมลง ไปจนถึงการวิจัย เช่น วัสดุในการบูรณะซ่อมแซม เป็นต้น อีกทั้ง ยังรับผิดชอบในการวางแผนกิจการที่เกี่ยวกับงานบูรณะซ่อมแซมครั้งใหญ่และการควบคุมดูแลรักษาซุยโฮเด็นอีกด้วย
มีนักท่องเที่ยว 1 แสน 6 หมื่นคนต่อปีมาเยือนที่ซุยโฮเด็น